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Real-Time PCR快速反应液(染料法)

Real-Time PCR快速反应液(染料法)

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产品名称: Real-Time PCR快速反应液(染料法)

英文名称: QuickFire qPCR PreMix(SYBR Green)

产品编号: HZ0105

产品价格: 0

产品产地: 中国/上海

品牌商标: 沪震生物

更新时间: 2023-08-17T10:24:20

使用范围: null

上海沪震实业有限公司
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 Real-Time PCR快速反应液(染料法)

中文名称:Real-Time PCR快速反应液(染料法)
英文名称:QuickFire qPCR PreMix(SYBR Green)
产品规格:125次|500次|5000次
本制品是采用SYBR Green I嵌合荧光法进行Real-Time PCR的专用试剂,可对目标DNA进行快速、特异性的定量检测。优化的预混液可缩短Real-Time PCR的反应时间,适用于标准或快速PCR仪。

QuickFire qPCR PreMix采用了抗体修饰的Anti Taq DNA聚合酶,配合独特的快速PCR Buffer体系可确保在所有的Real-Time PCR仪上进行灵敏的qPCR反应,具有反应快速、PCR反应时间缩短60%,同时具有高扩增效率,高扩增特异性和宽广的可信范围的特点,使你在不影响PCR效果的前提下更快获得结果,节约科研时间和能源。

产品特点:
·最快速:QuickFire系列的SYBR Green法产品,采用了可快速激活的抗体修饰Anti Taq DNA聚合酶,配合独特的快速Buffer体系,可节省多达60%的反应时间,成为目前市面上最快速的SYBR Green试剂。
·扩增能力强:扩增荧光信号强,结果更准确可信。
·稳定性好:Buffer中添加独特的PCR稳定剂和增强剂,使结果更稳定,重复性好,更准确可信。
·仪器广泛适用:不仅适用于快速荧光定量PCR仪,也适用于普通荧光定量PCR仪。
· ROX校正:单独包装的ROX染料,使用更灵活,结果更准确。

试剂盒原理:
本产品采用了特异的抗体修饰热启动DNA聚合酶进行快速PCR扩增,通过检测反应进程中SYBR Green I的荧光强度,达到检测PCR产物扩增量的目的,适用于标准和快速PCR仪。
1.本产品中特异的抗体修饰热启动DNA聚合酶,95℃条件下孵育1min即可激活全部酶活,在缩短变性时间的同时避免了非特异性产物的扩增。
2.本产品的快速PCR Buffer体系添加了独特的PCR稳定因子,配合精心优化的快速PCR Buffer体系,可大大缩短变性、退火和延伸时间,使PCR总运行时间缩短60%,更快获得实验结果,而不影响PCR反应效果。
3.本产品针对cDNA模板和gDNA模板结构组成的差异,对PCR的反应步骤进行了特别的优化,使较难扩增的gDNA模板也能获得良好的PCR结果。

试剂盒组成:

组分 20μl×125次 20μl×500次 20μl×5000次
2×QuickFire qPCR PreMix 1.25ml 4×1.25ml 40×1.25ml
50×ROX Reference Dye 250μl 1ml 10×1ml
RNase-Free ddH2O 2×1ml 5×1ml 50×1ml


储存条件:收到本产品后,请立即置于-20℃避光保存。从-20℃取出使用时,将冻存的QuickFire qPCR PreMix和ROX Reference Dye融解,然后轻轻颠倒混匀,待溶液完全均一后再行使用。如解冻后没有使用,须彻底混匀后重新冷冻。(在解冻过程中盐会出现分层现象,未混匀进行冷冻,盐晶体的析出将会对酶造成损害)。如需一段时间内经常取用,可在2~8℃条件下储存3个月。避免反复多次冻融。

注意事项:请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。
1.本产品中含有荧光染料SYBR Green I,保存本产品或配制PCR反应液时应避免强光照射。
2.如果试剂没有混匀,其反应性能会有所下降。使用时请上下颠倒轻轻混匀,请不要使用振荡器进行混匀,尽量避免出现泡沫,并经瞬时离心后使用。
3.引物纯度对反应特异性影响很大,建议使用PAGE级别以上纯化的引物。
4.引物终浓度为0.3μM可以在大多数体系中获得良好的扩增结果。如果需要进一步优化,可以在0.2-0.5 μM范围内调整引物浓度。
5.20μl反应体系中,cDNA模板的使用量一般小于100ng,基因组DNA模板量一般小于50 ng,逆转录产物作为模板时,使用量应不超过PCR体系终体积的20%。

操作步骤:

一、建立Real-Time PCR反应体系:
请注意将QuickFire qPCR PreMix和ROX Reference Dye避光保存。

1.融解QuickFire qPCR PreMix (如果保存在-20℃),ROX Reference Dye,模板,引物和RNase-Free ddH2O,并将所有试剂在室温下溶解并彻底混匀。
2.建议置于冰上进行Real-Time PCR反应液的配制。

成分 50μl体系 25μl体系 20μl体系 终浓度
2×QuickFire qPCR PreMix 25μl 12.5μl 10μl
正向引物(10 μM) 1.5μl 0.75μl 0.6μl 0.3μM①
反向引物(10μM) 1.5μl 0.75μl 0.6μl 0.3μM①
cDNA模板 - - -  
50×ROX Reference Dye② - - - -
RNase-free ddH2O 至50μl 至25μl 至20μl -


①引物终浓度为300 nM可以在大多数体系中获得良好的扩增结果。扩增效率不高时,可增加PCR反应体系中的引物浓度;发生非特异扩增时,可适当减少PCR反应体系中的引物浓度。需要进一步优化引物浓度的,可以在50-900 nM范围内调整。
②几种常见仪器的最适ROX Reference Dye浓度见下表:
 ABI PRISM 7000/7300/7700/7900HT/StepOne等:5×(例如5μl ROX/50μl体系)
 ABI 7500、7500 Fast;Stratagene Mx3000P、Mx3005P和Mx4000等:1×(例如:1μl ROX/50μl体系。
 Roche仪器,Bio-Rad仪器,Eppendorf仪器等:无需添加。
二、进行Real time PCR反应:
建议采用两步法PCR反应程序进行反应;若模板量较低等因素导致扩增效果不佳,可使用三步法程序进行PCR反应
两步法反应程序:

阶段 循环 温度 时间 内容 荧光信号采集
预变性 95℃ 1min 预变性
PCR反应 40× 95℃ 5sec 变性
60℃① 15sec② 退火/延伸
熔解曲线分析(Melting/Dissociation Curve Stage)


三步法反应程序:

阶段 循环 温度 时间 内容 荧光信号采集
预变性 95℃ 1min 预变性
PCR反应 40× 95℃ 5sec 变性
50-60℃③ 10sec 退火
72℃ 15sec② 延伸
熔解曲线分析(Melting/Dissociation Curve Stage)


①请先使用60℃ 15 sec进行扩增。如果需要进一步优化,可以尝试在56-66℃范围内进行。
②使用不同型号仪器进行时间设定时,请按照仪器使用说明书要求进行实验操作,几种常见仪器的时间设定如下:
 使用ABI 7700/7900HT/7500 Fast,Roche,BioRad和Agilent等公司荧光定量PCR仪时请设定在15 sec。
 使用ABI 7000和7300时请设定在31 sec。
 使用ABI7500时请设定在32 sec。
③通常引物退火温度比引物的解链温度(Tm)低5℃,如果引物碱基数较少,可以适当提高退火温度,这样可以使PCR的特异性增加;如果碱基数较多,那么可以适当减低退火温度。

3.盖上反应管,轻柔混匀。可短暂离心,确保所有组分均在管底。
4.将反应体系置于荧光定量PCR仪中,开始反应。

进行RT-qPCR反应时的操作建议:
进行RT-PCR反应时,有三种cDNA第一链合成试剂盒可以选择,分别是QuickQuant RT Kit(with gDNase),Quant cDNA第一链合成试剂盒,和BaiScript cDNA第一链合成试剂盒。

引物设计说明:
进行Real-time PCR反应时,PCR引物的设计非常重要。设计PCR扩增效率高,反应特异性强的引物可以参考以下要求。
1.引物长度:18-30个碱基。
2.GC含量:40-60%
3.Tm值:引物软件都可以给出Tm,与引物长度,碱基组成,引物使用缓冲的离子强度也有关。上下游引物的Tm值要尽量接近。简单的Tm计算公式为:Tm = 4℃(G + C)+ 2℃(A + T)。一般采用较引物Tm值低5℃作为PCR退火温度。提高退火温度可以增加PCR反应的特异性。
4.PCR扩增产物长度最好在100-150 bp之间。尽量避开在模板的二级结构区域设计引物。避免上下游引物3端之间形成2个或以上的互补碱基以减少引物二聚体的形成。引物3端碱基不能有多于3个连续的G或C。引物自身不应存在互补序列,否则引物自身会折叠成发夹状结构。避免引物3末端碱基为T。引物序列中A、T、G、C要尽量均匀分布。

常见问题:

1.无扩增信号或扩增曲线起峰晚或仅有引物二聚体

原因 解决办法
DNA模板中存在抑制剂 重新纯化模板或降低模板使用量
Mg2+浓度不合适 使用QuickFire qPCR PreMix时,PCR反应体系中Mg2+的终浓度为2mM。对有些扩增体系,可以将Mg2+终浓度提高到5 mM。进行Mg2+终浓度优化时,建议每次增加0.5 mM Mg2+浓度进行实验。
加样错误或试剂问题 检查试剂浓度和保存条件,包括所使用的引物和模板。重复进行实验。
PCR条件、引物序列或浓度不当 请确认引物未发生降解,引物浓度及PCR条件,扩增不好时,通常先尝试降低退火温度,延长退火时间和提高引物浓度,有时也可以提高退火温度,增加延伸时间,降低升温速度。对于GC含量高的模板,可以适当延长变性时间。如果还是扩增不好,请重新设计引物。
起始模板问题 检查起始模板的浓度,保存条件和质量。重新对模板进行线性梯度稀释,并用新稀释模板进行实验。增加起始模板使用量。


2.NTC出现较高的荧光值

原因 解决办法
试剂污染 建议使用新试剂进行实验。
PCR反应液配制时发生污染 采取必要的防污染策略(如使用带滤芯的枪头)。
引物出现降解 可以使用变性聚丙烯酰胺胶检测引物降解情况。


3.出现引物二聚体和(或)非特异扩增

原因 解决办法
Mg2+浓度不合适 使用QuickFire qPCR PreMix的反应体系含有Mg2+的终浓度为2mM。对有些扩增体系,可以将Mg2+终浓度增加到5 mM。建议每次增加0.5 mM Mg2+浓度进行优化。
PCR退火温度太低 建议每次增加2℃进行退火温度优化。
引物设计不合适 考虑重新设计引物序列。
PCR产物太长 荧光定量PCR产物长度最好在100-150 bp之间,而且不应该超过500 bp。
引物出现降解 可以使用变性聚丙烯酰胺胶检测引物降解情况。
计量误差 反应体积太小会导致检测精度下降。请根据定量PCR仪推荐的反应体积重新实验。


4.定量值重现性差

原因 解决办法
仪器方面的故障 因为仪器的不适用,在温度管理或检测时产生重现性差。请根据相应仪器的说明书进行点检。
样品纯度不好 不纯的样品会导致实验的重现性差。
稀释的模板放置太久 通过梯度稀释的模板最好现配现用。
引物质量下降 尽量避免新合成引物批次间的差异,可以使用原来质量好的引物做为对照。
PCR反应条件、引物浓度、序列等不恰当 扩增效率差的PCR较容易产生重现性差。通过变更引物的浓度或PCR反应条件来进行调整。扩增不好时,一般可降低退火温度或提高引物浓度,也可以延长延伸时间。如模板的GC含量较高,可延长变性时间。仍得不到改善时,建议重新设计引物。
计量误差 反应体积太小会导致检测精度下降。请根据定量PCR仪推荐的反应体积重新实验。

 

特别提示:本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!