稳定转染或持久的转染是用于建立克隆的细胞系，这种细胞系中转染的目的基因整合到染色体DNA中并指导适量目的蛋白的合成。一般来说（由细胞类型决定），形成稳定转染细胞的效率比瞬时转染的效率低1到2个数量级。

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脂质体介导转染，将目的基因导入细胞48小时后，目的基因即在细胞内表达。此时为了建立稳定细胞系

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可以通过测定线粒体酶活性或细胞膜完整性进行评估，并由总细胞中活细胞所占的百分比来衡量。

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常规转染技术可分为两大类，一类是瞬时转染，一类是稳定转染（永久转染）。前者外源DNA/RNA不整合到宿主染色体中，因此一个宿主细胞中可存在多个拷贝数，产生高水平的表达，但通常只持续几天，多用于启动子和其它调控元件的分析。一般来说，超螺旋质粒DNA转染效率较高，

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